随着上杉家将奥羽两州静谧后,就通过奥羽两州国分案,开始对原先雄踞北奥、津轻、中奥等地的南部家进行肢解,还将南部氏的一门总领之位交还给了波木井南部家出身的八户南部家,并将石川城、高水寺城、八户根城、志津川城等奥州的重镇要地都配置谱代家臣进行镇守。
上杉清定的目的就是将奥羽两州的政治势力碎片化,从而便于上杉家羁縻控驭。
如此一来,南部家在遭到上杉家重创后,还被拆分成了五家:三户南部家、四户南部家、七户南部家、八户南部家、久慈南部家。
这五家的关系若即若离,错综复杂,虽然被强行拆分,但又各自存在千丝万缕的密切联系,甚至被外界依然视为一个整体。而南家、北家、东家、堤家、石川家、石龟家、毛马内家、长牛家、石鸟谷家、大光寺堤家(堤南部家庶流)、一户家、九户家等大部分庶子家都因失领后,被迫随主家三户南部家一同迁往北奥的北郡之中。
所以,清定为了减小南部一族在北奥、津轻、中奥等地的影响力,将八户南部家转封至甲斐巨摩郡的旧领南部庄,还将七户南部家转封至中奥的岩手郡。
为了避免三户南部家迅速恢复元气,清定还特意将天间林铁山、大林铁山、葛泽金山、上北铜山、村上铜山、大扬铜山等北郡境内的矿山收为上杉家直领,仅仅给三户南部家保留了大凑、野地边凑两座规模不算太大的海港。
清定鉴于奥羽两州才得以静谧,以及交通、通信水平较差,加上上杉家的治下领国规模还在不断扩张,便利用自己兼任奥州管领役职的职权,将幅员较为辽阔的陆奥一国再度进行拆分,以便于上杉家的治理。
于是,清定便从陆奥境内析加美郡、玉造郡、远田郡、志田郡、气仙郡、本吉郡、登米郡、栗原郡、黑川郡、桃生郡、牡鹿郡、宫城郡、名取郡、柴田郡置陆前国;析闭伊郡、稗贯郡、和贺郡、胆泽郡、江刺郡、筑波郡、磐井郡、岩手郡、鹿角郡、九户郡置陆中国;析津轻之地的西浜郡、鼻和郡、山边郡、田舍郡、平贺郡、外浜郡置津轻国。
如此一来,陆奥国就只剩下北郡、三户郡、二户郡三郡之地。
当然,为了在出羽一国增强上杉家的影响力,清定还不忘派遣使者上奏朝廷,并通过近卫家从中斡旋,析出羽国北部的山本郡、秋田郡、仙北郡、河边郡、由利郡、平鹿郡、雄胜郡置羽后国;将南出羽的置赐郡、村山郡、最上郡、游佐郡、田川郡、栉引郡另置羽前国。
对于先前暗中与伊达稙宗有所往来,甚至还准备向上杉家举起反旗的二阶堂照行,于奥羽两州之地静谧后,被清定处以改易,虽免于一死,但与其家眷一同流放至陆中野田城,交由鲇贝宗信进行看管,其家臣暂时配置给八条房繁作为与力。
而石龟信房、一方井安正因自己的儿子、家眷死于非命之后,忧思难解,怨天尤人。还没抵达流放地,就先后郁悒而殁。不单单是南部家重臣们因失去儿子、家人而感到万分悲痛,陆奥、陆中、津轻等国境内,几乎家家紧闭门扉,念佛悲泣之声,不绝于耳。
在分配完奥羽两州的领地之后,清定还不忘对其余参阵诸将进行封赏:
河越城城主上杉定虎,静谧奥羽两州有功,加封武藏秩父郡御岳城、天神山城等地三万石知行地,仍担任镰仓府侍所执事、上总守护代、入间郡郡司、都筑郡郡司、橘树郡郡司、石田牧奉行、秩父牧奉行、立野牧奉行、遥领佐渡守护代、左龙捷备军奉行等职如故;
箕轮城城主长野业正,加封上野势多郡山上城一万石知行地,仍担任上野守护代、群马郡郡司、片冈郡郡司、那波郡郡司等职如故;
太田城城主佐竹义昭,协助静谧常陆一国有功,加封常陆茨城郡加仓井城一万石知行地,仍担任常陆守护代、下总守护代、评定众等职如故;
岩付城城主太田资正,加封武藏幡罗郡别府城一万五千石知行地,仍担任武藏守护代、琦玉郡郡司、足立郡郡司、横见郡郡司、丰岛郡郡司等职如故;
平井城城主加地春纲,转封至常陆茨城郡水户城,领有五万石知行地,改任茨城郡、那珂郡两郡郡司;
松井田城城主金津义旧,转封至常陆新治郡府中城,领有四万五千石知行地,改任新治郡郡司、信太郡郡代;
和田城城主和田业繁,转封至常陆筑波郡牛久城,领有两万一千石知行地,并担任筑波郡郡代之职;
大户城城主浦野重成,转封至常陆新治郡户崎城,领有两万石知行地;
会津若松城城主八条房繁,加封岩代河沼郡金上城一万五千石知行地,仍担任岩代守护代、白川郡郡司,右龙捷备军奉行、会津郡郡司等职如故;
金上城城主八条宪繁,转封至岩代安达郡四本松城,领有三万五千石知行地,并改任安达郡郡司;
岩尾城城主安田长秀,转封至岩代安达郡二本松城,领有两万五千石知行地,并改任安达郡郡代;
原横田中丸城城主山内舜通于净法寺城之战中阵亡,其女俊姬由清定收为养女,横田山内家家名由其长男山内俊胜来继承,并转封至下总印幡郡将门山城(原本佐仓城),领有两万两千石知行地,享有准一门格待遇,并担任印幡郡郡代之职;
庆德城城主下条实亲,转封至岩代岩濑郡三城目城,领有三万石知行地;
高玉城城主桃井义孝,转封至岩代岩濑郡须贺川城,领有三万五千石知行地,仍担任高玉铁山奉行如故;
大田原城城主上杉景信,协助静谧岩代、陆前、陆中、陆奥、羽后等国有功,转封至岩代伊达郡梁川城,领有五万五千石知行地,并改任伊达郡郡司;
直峰城城主斋藤朝信,协助静谧岩代、陆前、陆中、陆奥、羽后等国有功,加封越后刈羽郡赤田城一万五千石知行地,仍担任越后守护代、颈城郡郡司、春日山城城代、府中御所城代、府中町町奉行、右虎捷备军奉行等职如故;